Simona Panni
Ricercatore Confermato Biologia Molecolare
Dipartimento di Biologia Ecologia Scienze della Terra (DiBEST) Università della Calabria
Via Pietro Bucci, cubo6C
Phone : +39 0984-492920
Email : simona.panni@unical.it
Identificativi di ricerca :
Scopus Author ID 6506090490
Orchid ID 0000-0002-7500-4028
Formazione
Simona Panni si è laureata Scienze Biologiche con 110/110 cum laude presso Università di Roma “La Sapienza” con una tesi in Biologia Molecolare sull’ organizzazione strutturale del genoma eucariotico, svolta presso il Centro di Studio per gli Acidi Nucleici del CNR. Ha conseguito una Specializzazione in Applicazioni Biotecnologiche (equiparata con il Dottorato di Ricerca) presso l’ Università di Roma Tor Vergata, con una votazione finale di 50/50 cum laude ed una tesi sulla caratterizzazione di domini SH3 ottenuta costruendo librerie di proteine esposte sulla superficie capsidica di batteriofagi (Phage Display).
Nel 2011 ha conseguito l‘ abilitazione alla professione di Biologo
Nel 2017 ha ottenuto L‘ Abilitazione Scientifica Nazionale (ASN) come professore di seconda fascia in Biologia Molecolare
Carriera Accademica
Tra il 1997 ed il 2004 S.P. ha vinto diverse borse di studio incluse una borsa biennale dell’ Istituto Europeo di Oncologia (IEO), una borsa triennale della La Fondazione Italiana per la Ricerca sul Cancro (FIRC) ed un premio Telethon per lo studio della specificità di interazione mediato da domini proteici. Dal 2002 al 2005 è stata titolare di assegni di ricerca presso il Dipartimento di Biologia dell’ Università di Roma Tor Vergata. Nel 2003 ha vinto un grant ESF “Integrated Approaches for Functional Genomics” per lavorare come visiting researcher presso l’ Istituto Charite, della Humboldt-Universitat di Berlino dove ha avuto modo di apprendere tecniche avanzate per la sintesi di peptidi su carta (spot synthesis).
Dal 2006 è ricercatore in Biologia Molecolare presso il Dipartimento diBEST dell‘ Università della Calabria.
Attività di Ricerca
S.P è coautore di 45 documenti indicizzati da Scopus ed elencati nei seguenti siti:
https://scholar.google.com/citations?hl=it&user=hOGzkN0AAAAJ
https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=6506090490
https://orcid.org/0000-0002-7500-4028
Ha partecipato come oratore in numerosi congressi nazionali ed internazionali, di seguito elencati alcuni recenti:
Panni S. HUPO-PSI Meeting 11-13 May 2022 "NcRNAs in IntAct: the RNA entries" HUPO-PSI Meeting 11-13 May 2022 EMBL-EBI, Hinxton, Cambridge, UK.
Panni S. HUPO-PSI Meeting “The annotation of miRNAs in IntAct: Growth Failure in Early Childhood as a case study” March 22-26 2021 (virtual meeting)
Panni S. “ncRNAs in IntAct: state of the art and perspectives” HUPO-PSI Meeting March 23-26 2020 San Diego (virtual meeting)
Panni S. “Noncoding RNA regulatory networks: miRNAs and beyond“ Workshop “The role of text mining in curation workflows“ Malaga 21-22 Feb 2019
Panni S, Bateman A. Duesbury M, Perfetto L, Porras P, Orchard S and the IMEx Consortium “Building non-coding RNA networks in IntAct: from yeast to human” 12th International Biocuration Conference University of Cambridge, Cambridge, UK from April 7-10, 2019.
Panni S, Duesbury M, Perfetto L, Porras P, Orchard S and the IMEx Consortium “Building non-coding RNA networks in IntAct: from yeast to human” SIBBM 2018 Frontiers in Molecular Biology Rome, Italy, 20-22 June 2018 (Flash presentation)
Panni S. “Human ncRNA interactions: how to annotate them” HUPO-PSI Meeting April 18-20 2018 EMBL Heidelberg, Germany
Panni S. “ncRNAs interactions: a case study” Curation workshop on molecular and causal interactions. Rome, December 5-7 2017
Panni S, Prakash A. Bateman A, Orchard S “Yeast ncRNAs interactions: a case study” HUPO-PSI Spring Meeting, Ghent, Belgio. dal 18-20 April 2016
Panni S. The Phosphatase DUSP26 as a potential target to inhibit cell proliferation Bologna Peptides 14-16 February 2016
Membro della Scientific Organizing Committee “Gene Regulation Ensemble Effort for the Knowledge Commons (GREEKC)” Workshop Rende, 18-19 February 2020
Ha svolto attività di peer-reviewer per diverse riviste incluse Database, Proteomics, FEBS letters, Plos One, Briefing in Bioinformatics ed altre e ha svolto attività di peer-reviewer per progetti nazionali ed internazionali
Nel 2015 ha vinto un contributo per la mobilità dicercatori DR 2037 del 21/12/2015
Nel 2015, 2016 e 2017: Visiting Researcher presso l‘ istituto di Bioinformatica EBI, Hinxton (Cambridge, UK)
2018-2022 membro per l’ Italia della Management Committee per l’ Azione COST CA15205
Membro della Società italiana di Biofisica e Biologia Molecolare
Membro della International Society for Biocuration
Trasferimento Tecnologico
Co-founder della startup innovativa KazaamLab srl, divenuta anche spin-off presso l’ Università di Palermo. La startup ha ricevuto numerosi premi incluso il primo premio GET IT 2021 e il secondo posto nella Starcup Palermo 2019.
Brevetto per invenzione industriale n 102020000032753 depositato il 30-12-2020 e concesso il 1-02-2023
Attività Didattica
Dal 2011 professore titolare del corso Biologia Molecolare II (6CFU) per il corso di Laurea Triennale in Biologia
Dal 2019 professore titolare del corso Biologia Molecolare (6CFU) per il corso di Laurea Triennale in STB
2006-2010 professore titolare del corso Biologia Molecolare Eucariotica (5CFU) per il corso di Laurea Triennale in Scienze Biologiche
2007-2009 professore del corso Laboratorio di Biologia Molecolare e Biochimica (3CFU) per il corso di Laurea Triennale in Scienze Biologiche
Nel 2006 professore titolare del corso di Genomica (3CFU) per il corso di Laurea Specialistica in Scienze Biologiche
Nel 2005 professore a contratto del corso di Applicazioni della Bioinformatica (5 CFU) presso l’ Unical
2008 -2011 lezioni monografiche su “PPI networks” presso l’ Università di Pisa
Dal 2006 è relatore per numerose tesi di laurea triennale e magistrale e tutor per tirocini
Nel 2019 ha vinto un contributo per un progetto di didattica innovativa DR 1899 del 4/12/2018
Incarichi Istituzionali
2019-2022 Delegato Dipartimentale all’ Internazionalizzazione
2019-2022 Componente della Commissione per la Qualità del Dipartimento
2008-2022 Delegato all’ Internazionalizzazione per i CdS di Biologia e di Biotecnologie
Dal 2018 Valutatore esperto esterno dell’Organismo Preposto al Benessere Animale (OBPA)
Dal 2013 Membro del Collegio dei Docenti del Dottorato in Scienze della Vita
2008 -2011 Membro del Collegio dei Docenti del Dottorato in Ricerca Operativa della scuola di dottorato ISIMR
2006 -2008 Membro del Collegio dei Docenti del Dottorato in Biopatologia Molecolare
2014: Revisore esterno nel Dottorato in Biologia Cellulare e Molecolare del XXVII ciclo Dip. Di Biologia Università di Roma Tor Vergata.
2008: Membro della commissione di valutazione dell’ esame finale del Dottorato in Biologia Cellulare e Molecolare del XX ciclo Dip. Di Biologia Università di Roma Tor Vergata.
Finanziamenti
2019-2021: Partecipante al Programma di Ricerca PRIN “Membrane transporters, the doors of cellular metabolism. Investigation of biochemical features structure/function relationships, metabolic regulation and physio-pathological aspects by in vitro and in vivo experimental models.” Coordinatore prof. Cesare Indiveri
2018-2020: Cost Action GREEKC : “Gene Regulation Ensemble Effort for the Knowledge Commons” Coordinatore Prof.Martin Kuiper
2018: Ammessa al Finanziamento MIUR per attività di ricerca di base
2017-2020 Partecipante al Programma di Ricerca PRIN Tumor-targeting peptidomimetics: synthesis and bio-medical applications. Coordinatore prof Gennari
2013-2016 Partecipante al Programma di Ricerca PRIN “Sintesi e applicazioni biomediche di peptidomimetici in campo oncologico”. Coordinatore prof Gennari
Negli anni 1998-2008 sotto la supervisione scientifica del prof. Cesareni ha partecipato alle ricerche finanziate da numerosi progetti nazionali ed internazionali
-Partecipa ad un progetto triennale (1998-2001) finanziato dal Programma Nazionale per la Ricerca sull'AIDS
-Partecipa al Progetto di Ricerca di interesse Nazionale (PRIN) “Analisi di Fosfoproteomi” 2001-2003 Coordinatore nazionale prof. Lorenzo Pinna (Università di Padova)
-Partecipa al Progetto di Ricerca di interesse Nazionale (PRIN) 2003-2005 “Fosforilazione reversibile delle proteine: un approccio proteomico integrato”. Coordinatore nazionale prof. Lorenzo Pinna (Università di Padova) –
-Partecipa al progetto europeo Functional Proteomics: Towards defining the Interaction Proteome Coordinatore Prof. F.-Ulrich Hartl (Max Planck Institut fuer Biochemie)
-Partecipa al progetto AIRC 2004-2006 " An integrated approach for the assembly of protein networks and the discovery of functional pathways" .
-Partecipa al progetto AIRC 2006-2008 “An integrated approach for the assembly of protein networks and the discovery of functional pathways, II”